TrueCrypt выгодно отличается среди множества подобных ей программ простотой использования, поддержкой десятка алгоритмов шифрования и приверженности модели открытых исходников. Файлы-контейнеры созданные при помощи TrueCrypt не имеют опознавательных сигнатур, в отличии от того же PGP Disk. Монтируемый диск получает свою букву в системе и работа с ним не отличается от работы с другими дисками. Физически диск хранится в файле-контейнере, который ничем не отличается от прочих файлов на диске, его можно записать на флэш-носитель или компакт диск.
Имеется возможность создавать т.н. "скрытый" диск - криптодиск внутри криптодиска. В этом режиме диск имеет два пароля. Один для доступа к диску, другой для доступа к скрытой части диска. В случае насильственного принуждения к выдаче пароля, пользователь выдает первый пароль. Авторы программы уверяют, что даже зная этот пароль к диску обнаружить наличие скрытого диска невозможно без знания второго пароля.